Quid du mycobiote et du virobiote ?

Le microbiote ne contient pas que des bactéries. Il y aussi des virus (ou phages) et des champignons, dont le rôle est beaucoup moins connu. « Les phages joueraient un rôle dans la modulation de l'écologie bactérienne, explique le Pr Joël Doré. Une société de biotechnologie, Eligo Bioscience, développe des phages hyperintelligents, capables d'éliminer des bactéries spécifiques dans le microbiote ». Le mycobiome commence aussi à être exploré. Il serait important dans la modulation de la réponse dans les maladies inflammatoires de l'intestin.