Le pronostic des carcinomes épidermoïdes de l’oropharynx est meilleur chez les non-fumeurs HPV positifs. Selon une étude française, à deux ans, leur survie sans progression est significativement supérieure ; le risque de décès ou de récidive locale est significativement réduit par rapport aux patients HPV négatifs, et la survie globale significativement meilleure que dans les groupes HPV négatifs ou les HPV positifs mais fumeurs.